文章
Goranova M、Ochoa G、Maier P 和 Hoyle A (2022) 针对不同耐药水平细菌的抗生素给药方案的进化优化。医学中的人工智能，133，艺术。编号：102405。https://doi.org/10.1016/j.artmed.2022.102405
关于我
2015 年至今 高级讲师 - milan米兰体育 2006-2015 讲师 - milan米兰体育 2005-2006 研究助理 - 利物浦大学 2002-2005 博士 - 利物浦大学 1999-2002 数学学士学位 - 利物浦大学
水生环境中的抗生素耐药性：抗生素耐药性是世界面临的最大威胁之一，它影响着生活的各个领域。我们正在使用数学建模技术来研究耐药性如何通过水生环境中的细菌群体传播。此外，我们使用计算优化技术来得出抗生素使用策略，在目标函数和约束条件下进行各种设置，从而减缓/防止耐药性的形成。模拟 Gyrodactylus salaris 对英国大西洋鲑鱼种群的长期影响：目前英国没有 G. salaris。我们正在使用数学建模技术来估计这种大型寄生虫的爆发对英国大西洋鲑鱼种群的影响，以及随后如果寄生虫长期存在，宿主（鲑鱼）将如何进化出自然抵抗力，正如其他国家的同等种群所证明的那样。然而，这种抵抗力并不是免费的，因此我们研究了免疫反应的产生如何与其他生活史特征的成本进行权衡。宿主抵抗力、免疫力和免疫范围的进化：免疫反应是宿主进化来对抗寄生虫感染的最强大武器之一，但仍有很多我们不知道的事情。在这里，我们使用进化技术，包括适应性动力学，来了解宿主免疫系统是如何发展的。特别是宿主的免疫范围（对一种菌株的免疫力是否可以保护宿主免受类似菌株的侵害），这将有助于理解为什么我们对某些感染具有终生免疫力，但随着时间的推移，会看到另一种寄生虫的各种菌株不断爆发。
教育
数学学士利物浦大学
数学生物学博士利物浦大学
研究项目 (4)
环境和生物科学数学建模简介 PI：安德鲁·霍伊尔博士资助者：自然环境研究委员会 –
环境和生物科学数学建模简介 PI：雷切尔·诺曼教授资助者：自然环境研究委员会 –
环境和生物科学数学建模简介 PI：雷切尔·诺曼教授资助者：自然环境研究委员会 –
进化行为 PI：安德鲁·霍伊尔博士资助方：卡内基信托基金 –
输出 (26)
文章
Benson L、Davidson RS、Green DM、Hoyle A、Hutchings MR 和 Marion G (2021) 何时以及为何可以将直接传播模型用于环境持久性病原体。PLOS 计算生物学，17 (12)，艺术。编号：e1009652。 https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1009652
文章
Hoyle A、Cairns D、Paterson I、McMillan S、Ochoa G 和 Desbois AP (2020) 通过不同剂量和时间优化抗生素对抗全身感染的功效。PLOS 计算生物学，16（8），艺术。编号：e1008037。 https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1008037
会议论文（已发布）
Goranova M、Contreras-Cruz MA、Hoyle A 和 Ochoa G (2020) 使用基于群体的多目标算法优化抗生素治疗。在：CEC 2020：进化计算大会。 2020 年 IEEE 进化计算大会 (CEC)，英国格拉斯哥，2020 年 7 月 19 日至 2020 年 7 月 24 日。美国新泽西州皮斯卡塔韦：IEEE。 https://doi.org/10.1109/cec48606.2020.9185489
文章
Ochoa G、Christie LA、Brownlee AE 和 Hoyle A (2020) 抗生素治疗的多目标进化设计。医学中的人工智能，102，艺术。编号：101759。https://doi.org/10.1016/j.artmed.2019.101759
文章
一种模型可以统治所有这些？针对人类、动物和植物流行病的 OneHealth 建模方法
Kleczkowski A、Hoyle A 和 McMenemy P (2019) 一个模型可以统治所有这些？针对人类、动物和植物流行病的 OneHealth 建模方法。哲学汇刊 B：生物科学，374 (1775)，艺术。编号：20180255。https://doi.org/10.1098/rstb.2018.0255
会议论文（已发布）
Scott E、Nicol J、Coulter J、Hoyle A 和 Shankland C (2017) 层处理代数：应用于癌症治疗的多尺度集成建模。见：Bracciali A、Caravagna G、Gilbert D 和 Tagliaferri R（编辑）生物信息学和生物统计学的计算智能方法。 CIBB 2016。计算机科学讲义，10477。CIBB2016：第十三届生物信息学和生物统计学计算智能方法国际会议，英国milan米兰体育官网，2016 年 9 月 1 日至 2016 年 9 月 3 日。 Cham，瑞士：施普林格，第 118-133 页。 https://doi.org/10.1007/978-3-319-67834-4_10
文章
预测引入 Gyrodactylus salaris Malmberg 后大西洋鲑鱼 (Salmo salar L.) 种群自然恢复的潜力，1957 年 (Monogenea)
Denholm SJ、Hoyle A、Shinn A、Paladini G、Taylor NGH 和 Norman R (2016) 预测引入 Gyrodactylus salaris Malmberg 后大西洋鲑鱼 (Salmo salar L.) 种群自然恢复的潜力，1957 年 (Monogenea)。公共图书馆一号，11（12），艺术。编号：e0169168。 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0169168
文章
Paterson IK、Hoyle A、Ochoa G、Baker-Austin C 和 Taylor NGH (2016) 优化抗生素使用以治疗细菌感染。科学报告，6，艺术。编号：37853。https://doi.org/10.1038/srep37853
会议论文（已发布）
分层过程代数：一种用于多尺度集成建模的语言，以细胞周期和 DNA 损伤案例研究为例
Scott E、Hoyle A 和 Shankland C (2016) 层处理代数：多尺度集成建模语言，以细胞周期和 DNA 损伤案例研究为例。见：Bracciali A 和 Caravagna G（编辑）生物信息学和生物统计学计算智能方法论文集。第十三届生物信息学和生物统计学计算智能方法国际会议，milan米兰体育官网，2016 年 9 月 1 日至 2016 年 9 月 3 日。milan米兰体育官网：milan米兰体育，第 240-246 页。 http://www.cs.stir.ac.uk/events/cibb2016/index.html
文章
Garbutt J、Little TJ 和 Hoyle A (2015) 母体对后代消费的影响可以稳定波动的捕食者-猎物系统。英国皇家学会会刊 B：生物科学，282 (1820)，艺术。编号：20152173。https://doi.org/10.1098/rspb.2015.2173
文章
Best A 和 Hoyle A (2013) 有限的宿主免疫范围有利于寄生虫毒力多样性的产生和维持。界面焦点，3（6），艺术。编号：20130024。https://doi.org/10.1098/rsfs.2013.0024
文章
Denholm SJ、Norman R、Hoyle A、Shinn A 和 Taylor NGH (2013) 生殖权衡可能会减轻气候温暖地区的轮指龙的影响。公共图书馆一号，8（10），艺术。编号：e78909。 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0078909
会议论文（已发布）
PEPA 牡蛎：将动态能量预算模型转换为 Bio-PEPA，以太平洋牡蛎案例研究为例
Scott E、Hoyle A 和 Shankland C (2013) PEPA 牡蛎：将动态能源预算模型转换为 Bio-PEPA，以太平洋牡蛎案例研究为例。见：Bradley J、Heljanko K、Knottenbelt W 和 Thomas N（编辑）第 296 卷。PASM'12：第六届随机建模实际应用国际研讨会，英国伦敦帝国理工学院，2012 年 9 月 17 日至 2012 年 9 月 17 日。爱思唯尔，第 211-228 页。 https://doi.org/10.1016/j.entcs.2013.07.014
文章
Best A 和 Hoyle A (2013) 昂贵的获得性免疫记忆的进化。生态与进化，3 (7)，第 2223-2232 页。 https://doi.org/10.1002/ece3.611
文章
Lintott R、Norman R 和 Hoyle A (2013) 在斑块环境中增加扩散对疾病控制的影响。理论生物学杂志，323，第 57-68 页。 https://doi.org/10.1016/j.jtbi.2013.01.027
文章
放养方法和寄生虫引起的捕获量减少：鳟鱼渔业中的Argulus foliaceus 模型
McPherson N、Norman R、Hoyle A、Bron J 和 Taylor NGH (2012) 放养方法和寄生虫引起的捕获量减少：对鳟鱼渔业中的Argulus foliaceus 进行建模。理论生物学杂志，312，第 22-33 页。 https://doi.org/10.1016/j.jtbi.2012.07.017
文章
Hoyle A、Best A 和 Bowers R (2012) 宿主抵抗病原体排斥的演变：捕食者的作用。进化生态学研究，14 (2)，第 125-146 页。 http://www.evolutionary-ecology.com/abstracts/v14/2723.html
文章
Hoyle A、Bowers R 和 White A (2011) 进化行为、权衡以及循环和混沌种群动态。数学生物学通报，73 (5)，第 1154-1169 页。 https://doi.org/10.1007/s11538-010-9567-7
文章
Greenman J & Hoyle A (2010) 从生态流行病学系统中排除病原体。美国博物学家，176 (2)，第 149-158 页。 https://doi.org/10.1086/653669
文章
Hoyle A & Gilburn A (2010) 性对抗共同进化：模型和实证检验。进化生物学杂志，23 (1)，第 166-174 页。 https://doi.org/10.1111/j.1420-9101.2009.01886.x
文章
Hoyle A & Bowers R (2008) 可能的进化结果可以直接从种群动态中确定吗？理论群体生物学，74 (4)，第 311-323 页。 https://doi.org/10.1016/j.tpb.2008.09.002
文章
Greenman J & Hoyle A (2008) 排除多宿主群落中的通用病原体。美国博物学家，172 (4)，第 576-584 页。 https://doi.org/10.1086/590967
文章
Hoyle A、Bowers R、White A 和 Boots M (2008) 权衡形状对经典生态场景中进化行为的影响。理论生物学杂志，250 (3)，第 498-511 页。 https://doi.org/10.1016/j.jtbi.2007.10.009
文章
捕食者-被捕食者系统中的进化分支何时可能具有明确的承载能力？
Hoyle A & Bowers R (2007) 捕食者-被捕食系统中的进化分支何时可能具有明确的承载能力？。数学生物科学，210 (1)，第 1-16 页。 https://doi.org/10.1016/j.mbs.2007.06.001
文章
Bowers R、Hoyle A、White A 和 Boots M (2005) 适应性进化的几何理论：权衡和入侵图。理论生物学杂志，233 (3)，第 363-377 页。 https://doi.org/10.1016/j.jtbi.2004.10.017