米兰体育官方网站 Ceratothoa oesroides 的群落参数和全基因组 RAD-Seq 位点暗示其在养殖欧洲鲈鱼和野生养殖场聚集鱼类之间转移

引用

Mladineo I、Hrabar J、Trumbić Ž、Manousaki T、Tsakogiannis A、Taggart JB 和 Tsigenopoulos CS (2021) Ceratothoa oesroides 的群落参数和全基因组 RAD-Seq 位点暗示其在养殖欧洲鲈鱼和野生农场聚集鱼类之间的转移。病原体，10 (2)，艺术。编号：100。https://doi.org/10.3390/pathogens10020100

摘要
聚集在商业海水养殖场内用于觅食和庇护的野生鱼类群落被认为是病原性寄生虫的主要来源，这些寄生虫被传染给网栏内密度较高的养殖鱼类。为了评估 Ceratothoa oesroides（Isopoda、Cymothoidae）（一种常见于亚得里亚海和希腊养殖欧洲鲈鱼（Dicentrarchus labrax）种群中的通才和瘟疫等足类动物）是否在野生鱼和养殖鱼之间转移，采用了 RAD-Seq（限制性位点相关 DNA 测序）介导的遗传筛查方法。对从养殖欧洲鲈鱼 (138) 和不同野生养殖场聚集鱼 (172) 中采集的 310 个 C. oesroides 样本进行双消化 RAD-Seq，鉴定出 313 个稳健的 SNP，证明“野生”和“养殖”基因型之间存在密切的遗传相关性。 ddRAD-Seq 被证明是检测 C. oesroides 离散遗传结构和两个种群之间基因型混合的有效方法。养殖鲈鱼的寄生虫患病率为1.02%，平均强度为2.0，平均丰度为0.02，而野生鱼类的寄生虫患病率为8.1%；平均强度，1.81；平均丰度为 0.15。这种差异可能是养殖鱼类饲养周期中人为干预的结果，然而，这并没有影响 C. oesroides 的转移。

关键字
角藻；拉布拉克斯二叉戟；意味着丰富；平均强度；寄生虫转移；患病率； RAD测序

期刊
病原体：第 10 卷，第 2 期

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