文章
详情
引用
Pavelin J、Jin YH、Gratacap RL、Taggart JB、Hamilton A、Verner-Jeffreys DW、Paley RK、Rubin C、Bishop SC、Bron JE、Robledo D 和 Houston RD (2021) nedd-8 激活酶基因是对传染性胰腺坏死的遗传抗性的基础 大西洋鲑鱼中的病毒。基因组学,113 (6),第 3842-3850 页。 https://doi.org/10.1016/j.ygeno.2021.09.012
摘要大西洋鲑鱼对传染性胰腺坏死病毒 (IPNV) 的遗传抗性是单基因座 (QTL) 解释几乎所有遗传变异的性状的罕见例子。基于鲑鱼26号染色体上的QTL的遗传标记测试已广泛应用于选育中,以显着降低该疾病的发病率。在当前的研究中,应用全基因组测序和功能注释方法来表征QTL区域的基因和变异。通过对受到 IPNV 攻击的纯合抗性基因型和纯合易感基因型的鲑鱼鱼苗之间的差异表达分析进行了补充。这些分析指出 NEDD-8 激活酶 1 (nae1) 基因是 QTL 效应的推定功能候选基因。通过 CRISPR-Cas9 敲除大西洋鲑鱼细胞系中的 nae1 基因和化学抑制 nae1 蛋白活性,进一步评估了 nae1 在 IPN 抗性中的作用,这两种方法均导致有效 IPNV 复制的显着减少。相比之下,用 CRISPR-Cas9 敲除先前被认为是病毒细胞受体 (cdh1) 的候选基因,并没有对 IPNV 的高效复制产生重大影响。这些结果表明,nae1 是影响鲑鱼 IPNV 抗性的主要 QTL 的致病基因,为 neddylation 在宿主-病原体相互作用中的关键作用提供了进一步的证据,并强调了将高通量基因组学方法与靶向基因组编辑相结合以了解疾病抗性的遗传基础的价值。
关键字QTL;抗病性;基因编辑技术;全基因组重测序;基因表达;水产养殖
期刊基因组学:第 113 卷,第 6 期
| 状态 | 已发布 |
|---|---|
| 资助者 | BBSRC 生物技术和生物科学研究委员会 |
| 发布日期 | 30/11/2021 |
| 在线发布日期 | 20/09/2021 |
| 期刊接受日期 | 13/09/2021 |
| 网址 | http://hdl.handle.net/1893/33394 |
| ISSN | 0888-7543 |
人 (1)
水产养殖研究所教授