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Sturm A、Carmona-Antoñanzas G、Humble JL、Croton C、Boyd S、Mphuti R、Taggart JB、Bassett DI、Houston RD、Gharbi K、Bron JE 和 Bekaert M (2024) QTL 作图提供了有关鲑鱼虱子 Lepeophtheirus sharkis 中甲维菌素苯甲酸盐抗性的新见解。BMC 基因组学,25 (1)。 https://doi.org/10.1186/s12864-024-11096-2
摘要背景 鲑鱼虱(Lepeophtheirus Salaris)是野生和养殖鲑鱼的寄生虫,对北半球大西洋鲑鱼(Salmo salar)的商业养殖造成巨大的经济损失。阿维菌素甲维盐苯甲酸盐 (EMB) 广泛用于鲑鱼除虱。虽然对 EMB 的抗性在大西洋鲑鱼种群中普遍存在,但抗性的分子机制仍有待阐明。目前工作的目的是通过鉴定与 EMB 抗性相关的遗传和转录组标记来深入了解潜在的 EMB 抗性机制。 结果 在 EMB 敏感和抗性鲑鱼之间进行杂交,这些鲑鱼来自在苏格兰分离的两个亲本菌株,产生完全纯系的家族。使用反应时间生物测定来表征个体寄生虫的 EMB 敏感性。对两个科的寄生虫进行双消化限制性位点相关 DNA 测序 (ddRAD-seq),以同时发现单核苷酸多态性 (SNP) 和基因分型。数据分析显示,EMB 抗性与鲑鱼 5 号染色体上的一个数量性状基因座 (QTL) 区域相关。通过对另外两个科中 7 个 SNP 的基因分型测定,证实了标记-性状关联。此外,还评估了 EMB 敏感和抗性鲑鱼亲本菌株的雄性寄生虫的转录组。与药物敏感虱子相比,在 EMB 抗性虱子中表现出更高转录本表达的 18 个序列中,上调最强烈的基因位于上述 QTL 区域,并与 β 血影蛋白(一种在神经元结构和功能中发挥作用的细胞骨架蛋白)具有高度同源性。 EMB 抗性虱子中受到差异调节的其他基因包括谷胱甘肽 S-转移酶 (GST),以及编码在线粒体功能、细胞内信号传导或转录中具有预测作用的蛋白质的基因。 结论 鲑鱼 EMB 抗性的主要决定因素位于 5 号染色体上。可以使用有限数量的遗传标记来预测抗性。 EMB 抗性寄生虫中转录上调的基因包括 β 血影蛋白(一种在神经元结构和功能中的作用仍不完全了解的细胞骨架蛋白)以及谷胱甘肽 S-转移酶(一种在针对毒物的生化防御中具有潜在作用的酶)。
关键字海虱;水产养殖;寄生虫;耐药性;遗传学;鲑鱼 Lepeophtheirus
期刊BMC Genomics:第 25 卷,第 1 期
| 状态 | 已发布 | 
|---|---|
| 资助者 | 生物技术和生物科学研究委员会, 生物技术和生物科学研究委员会, 苏格兰鲑鱼, 苏格兰海洋科技联盟, PHARMAQ和农林渔业部 | 
| 在线发布日期 | 31/12/2024 | 
| 期刊接受日期 | 27/11/2024 | 
| 网址 | http://hdl.handle.net/1893/36870 | 
| 发布商 | 施普林格科学与商业媒体有限责任公司 | 
| eISSN | 1471-2164 |