milan米兰体育app下载 234 只埃塞俄比亚本土非洲鸡的全基因组序列

引用

Gheyas A、Vallejo-Trujillo A、Kebede A、Dessie T、Hanotte O 和 Smith J (2022) 234 只埃塞俄比亚本土非洲鸡的全基因组序列。科学数据，9 (1)，艺术。编号：53。https://doi.org/10.1038/s41597-022-01129-4

摘要
本土鸡在非洲家禽生产中占主导地位。尽管由于它们能够适应恶劣的热带环境而成为后院农业的首选，但与商业品系相比，这些种群的生产力相对较低。基因组分析可以揭示这些鸟类在生产和恢复性状方面的遗传潜力，从而造福于非洲家禽养殖系统。在这里，我们报告了来自分布在不同农业气候条件下的 24 个埃塞俄比亚种群的 234 只本土鸡的全基因组序列。这些数据代表来自 Ilumina HiSeqX 平台的超过 8 TB 的双端序列，平均覆盖率约为 57X。几乎 99% 的序列读数可以映射到鸡参考基因组 (GRCg6a)，从而证实了数据的高质量。变异检出检测到约 1500 万个 SNP，其中约 86% 是已知变异（即存在于公共数据库中），这为数据质量提供了进一步的信心。该数据集为研究遗传多样性和当地环境适应提供了极好的资源，对品种改良和保护目的具有重要意义。

关键字
农业遗传学；遗传标记；基因组学；新一代测序

期刊
科学数据：第 9 卷，第 1 期

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