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Van Vu S、O’Connor W、Vu IV、Gondro C、Nguyen T、Kundu S、Woo K、Lee S、Khanh T、Nguyen T、Doan H、Htoo H 和 Gheyas A (2025) 葡萄牙牡蛎壳生长、状况指数、壳和外套膜颜色的全基因组关联研究 角形。国际水产养殖,33。https://doi.org/10.1007/s10499-025-02210-6
摘要葡萄牙牡蛎 (Crassostrea angulata) 是一种具有重要商业价值的水产养殖品种,迅速受到欢迎,特别是在亚洲。与生长相关的性状以及贝壳和外套膜的颜色是养殖牡蛎市场价值的关键决定因素。为了支持育种计划中的性状改良,本研究利用全基因组关联研究(GWAS)研究了经济重要性状的遗传结构,包括壳长、壳高、壳宽、状况指数以及壳和外套膜颜色。利用 DArTseq 技术,对越南育种计划两代的 647 个牡蛎样本进行了基因分型:第一代 57 个全同胞家族的 188 个样本,第二代 33 个全同胞家族的 459 个样本。 GWAS 鉴定了 31 个与各种性状相关的重要 SNP,其中 24 个映射到蛋白质编码基因。与生长性状相关的值得注意的候选基因包括 CE128 样 (LOC128177318) 和 WIPI3 样 (LOC128167327),分别与蛋白质定位和自噬有关。对于颜色相关性状,关键候选基因包括葡萄糖脱氢酶 (LOC128184820)、Neurobeachin-like (LOC128156661) 和 POP1-like (LOC128164428),它们与催化活性、膜运输和 RNA 加工相关,表明在色素沉着和生物矿化中发挥作用。此外,新钙调蛋白样 (LOC128183296)(一种参与钙结合的基因)被确定为贝壳颜色的候选基因,与其他牡蛎物种的发现一致。所有性状中显着的 SNP 的小效应表明多基因控制,强调了基因组选择对于性状改善的潜力。这项研究为选择性育种计划提供了基础见解,旨在增强 C. angulata 的生长和美观性状,从而促进牡蛎养殖的可持续性和盈利能力。
关键字角牡蛎;葡萄牙生蚝; GWAS; 生长性状;颜色特征
注释收稿日期:2025 年 3 月 7 日/接受日期:2025 年 8 月 16 日 © Crown 2025;研究处理编辑:Pierre Boudry 文章最后一页提供了详细的作者信息
期刊国际水产养殖:第 33 卷
| 状态 | 已发布 |
|---|---|
| 资助者 | milan米兰体育 |
| 发布日期 | 30/09/2025 |
| 在线发布日期 | 30/09/2025 |
| 期刊接受日期 | 16/08/2025 |
| 网址 | http://hdl.handle.net/1893/37401 |
| ISSN | 0967-6120 |
| eISSN | 1573-143X |
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水产养殖研究所水产养殖生产科学讲师